Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Fndc8Q9D2H8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Fndc8Q9D2H8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Fndc8Q9D2H8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc8Q9D2H8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms