Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc167Q9D162 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc167Q9D162 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc167Q9D162 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc167Q9D162 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc167Q9D162 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc167Q9D162 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc167Q9D162 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc167Q9D162 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms