Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Sgo1Q9CXH7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Sgo1Q9CXH7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Sgo1Q9CXH7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Sgo1Q9CXH7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Sgo1Q9CXH7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Sgo1Q9CXH7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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