Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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