Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms