Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Khdc3Q9CWU5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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