Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms