Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MINDY3Q9CV28 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms