Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sft2d3Q9CSV6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms