Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm42683-201ENSMUST00000196136 2328 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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