Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms