Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl11Q9CQF0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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