Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms