Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms