Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms