Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cox6cQ9CPQ1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cox6cQ9CPQ1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2129.2 ms