Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup155Q99P88 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms