Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brms1Q99N20 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms