Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tlr3Q99MB1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tlr3Q99MB1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Tlr3Q99MB1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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