Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp16Q99LG0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms