Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms