Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms