Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms