Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Ddb2Q99J79 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Ddb2Q99J79 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Ddb2Q99J79 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Ddb2Q99J79 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Ddb2Q99J79 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Ddb2Q99J79 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Ddb2Q99J79 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Ddb2Q99J79 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Ddb2Q99J79 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Ddb2Q99J79 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Ddb2Q99J79 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Ddb2Q99J79 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ddb2Q99J79 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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