Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan1Q99J59 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan1Q99J59 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms