Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms