Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim59Q922Y2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms