Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q8VDP2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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