Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Slc6a20aQ8VDB9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Slc6a20aQ8VDB9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Slc6a20aQ8VDB9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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