Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgip1Q8VD37 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms