Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Nup58Q8R332 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nup58Q8R332 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nup58Q8R332 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Nup58Q8R332 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Nup58Q8R332 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Nup58Q8R332 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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