Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf183Q8QZS5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf183Q8QZS5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf183Q8QZS5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf183Q8QZS5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf183Q8QZS5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf183Q8QZS5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnf183Q8QZS5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnf183Q8QZS5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rnf183Q8QZS5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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