Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms