Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OptnQ8K3K8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms