Protein–RNA interactions for Protein: Q8K327

Champ1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Champ1Q8K327 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Champ1Q8K327 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms