Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stn1Q8K2X3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms