Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Abcf3Q8K268 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Abcf3Q8K268 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Abcf3Q8K268 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Abcf3Q8K268 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Abcf3Q8K268 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Abcf3Q8K268 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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