Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pnma3Q8JZW8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pnma3Q8JZW8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma3Q8JZW8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms