Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hpf1Q8CFE2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hpf1Q8CFE2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hpf1Q8CFE2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hpf1Q8CFE2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hpf1Q8CFE2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hpf1Q8CFE2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hpf1Q8CFE2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hpf1Q8CFE2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hpf1Q8CFE2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hpf1Q8CFE2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Hpf1Q8CFE2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Hpf1Q8CFE2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Hpf1Q8CFE2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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