Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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