Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Lrif1Q8CDD9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Lrif1Q8CDD9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Lrif1Q8CDD9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Lrif1Q8CDD9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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