Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Fbxo48Q8CAT8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo48Q8CAT8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms