Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc113Q8C5T8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms