Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cnot2Q8C5L3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms