Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx16Q8C080 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms