Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms