Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms