Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nop53Q8BK35 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Nop53Q8BK35 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Nop53Q8BK35 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Nop53Q8BK35 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nop53Q8BK35 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nop53Q8BK35 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nop53Q8BK35 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nop53Q8BK35 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nop53Q8BK35 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nop53Q8BK35 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Nop53Q8BK35 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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