Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cdca8Q8BHX3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cdca8Q8BHX3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms