Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npm2Q80W85 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Npm2Q80W85 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms